# Tool For Analysis of Images in Experiments

## Documentation for package ‘ExpImage’ version 0.8.0

- DESCRIPTION file.
- User guides, package vignettes and other documentation.

## Help Pages

ExpImage-package | ExpImage: Experimental Image Analysis Tools
as_image | Transform matrix into image (Transformar matriz em imagem).
calibration_palette | Function to create a color palette for image color calibration (Funcao para criar uma paleta de cores para calibracao das cores de imagens).
classify_image | Filter values in an array or image (Filtrar valores em uma matriz ou imagem).
clustering_Kmeans | Image segmentation by clustering using the Kmeans method (Segmentacao de imagens pela clusterização pelo metodo Kmeans).
color_pallete | Creates a color palette from an image (Criar uma paleta de cores a partir de uma imagem).
compare_image | Function to compare image sizes (Funcao para comparar os tamanhos das imagens).
contour_image | Contorno da imagem segmentada (Outline of the segmented image.)
convert_color | Convert colors (Converter cores).
create_png | Create a png image with a transparent background (Criar uma imagem png com o fundo transparente)
crop_image | Esta funcao corta a imagem retirando as laterais nao desejadas. (This function removes unwanted sides from the images.)
dilate_image | Funcao para acrescentar bordas nos objetos.
edit_image | This function changes the brightness, contrast and makes the gamma adjustment in the image (Esta funcao permite mudar o brilho, contraste e fazer um ajuste gamma na imagem).
edit_imageGUI | This function changes the brightness, contrast and makes the gamma adjustment in the image (Esta funcao permite mudar o brilho, contraste e fazer um ajuste gamma na imagem).
erode_image | Funcao para eliminar as bordas dos objetos.
example_image | Images used as an example (Banco de imagens utilizadas como exemplo).
exclude_object | Exlude objects in an image by encircling them or using a mask (Excluir objetos em uma imagem circundado-os ou usando uma mascara).
ExpImage | ExpImage: Experimental Image Analysis Tools
extract_pixels | Function to exclude pixels from the background or foreground in an image (Funcao para excluir em uma imagem os pixels correspondente ao background ou foreground)
getwd_script | Obter o diretorio onde esta o script. (Get the script directory.)
gray_scale | Function to get a grayscale image from a color image (Funcao para a obtencao de uma imagem em escala de cinza a partir de uma imagem colorida)
histogram_image | Create a histogram from image bands (Criar um histrograma a partir das bandas das imagens)
index_bands | Estimation of vegetation indices (Estimacao de indices de vegetacao).
info_image | Image information (Informacoes sobre as imagens).
join_bands | Function to compare image sizes (Funcao para comparar os tamanhos das imagens).
join_image | Join images(Juntar imagens)
linearize_image | Image linearization (Linearizacao da imagem).
mask_pixels | Creates a mask over the background or foreground (Cria uma mascara sobre o background ou foreground)
mask_raster | Creates a mask over the background or foreground in a raster image (Cria uma mascara sobre o background ou foreground em uma imagem no formato raster)
measure_image | Function to obtain measurements associated with objects in binary images (Funcao para obter medidas associadas aos objetos em imagens binarias).
normalize_image | Create a histogram from image bands (Criar um histrograma a partir das bandas das imagens)
Normatiza | Normatiza a matriz para que os valores variem entre valores pre-estabelecidos.
pick_circle | Segmentation with the shape of a circle by clicking on the image (Segmentacao com o formato de um circulo clicando em na imagem)
pick_color | Selecionar os valores de RGB em pixels (Selecting RGB values in pixels).
pick_count | Count objects (Contar objetos).
pick_length | Measure objects in the image on click (Medir objetos na imagem ao clicar).
pick_palette | Obter uma paleta de cores com cliques (Get a color palette with clicks ).
pick_resolution | Get the dpi resolution on an image (Obter a resolução em dpi em uma imagem).
pick_segmentation | Segmenting objects manually (Segmentação de objetos manualmente)
plot_image | Esta funcao plota imagens. (This function plot the images.)
plot_indexes | Function to plot multiple indices (funcao para plotar varios indices)
plot_meansures | Funcao para sobrepor informacoes sobre os objetos da imagem
predict_logit | Segmentacao a partir de modelo logit (Segmentation from the logit model)
predict_RF | Pixel classification by Random Forest methodology (Classificacao de pixels pela metodologia Random Forest)
raster2image | Convert a image in raster format to ExpImage format (Converte uma imagem no formato raster para o formato ExpImage)
read_image | Function to import an image (Funcao para importa uma imagem).
resize_image | Function to change image size (Funcao para mudar o tamanho da imagem)
rotate_image | Esta funcao rotaciona a imagem. (This function rotates the image .)
segmentation | Image segmentation function (Funcao para a segmentacao de imagens).
segmentation_logit | Funcao para a segmentacao de imagens.
segmentation_logitGUI | Funcao para a segmentacao de imagens.
segmentation_RF | Image segmentation by Random Forest (Segmentacao de imagens por Random Forest).
segmentation_steps | Image segmentation function (Funcao para a segmentacao de imagens).
setwd_script | Definir o diretório do script working directory (Set the script Directory as working directory).
shape_file.BorderExtract | Excluir as bordas do objetos/parcelas do shapefile
shape_file.create | Funcao para criar as coordenadas dos objetos/parcelas na imagem
shape_file.plot | Plotar os objetos/parcelas do shapefile na imagem
shape_file.split | Divide a imagem em objetos/parcelas de acordo com o shapefile
skeletonize_image | Function for skeletonization in images (Esta funcao faz a skeletonizacao em imagens).
split_image | This function splits the image into several others (Esta funcao divide a imagem em varias outras de acordo com os objetos que contem)
square_image | Transform the square image (Transforme a imagem quadrada).
summary_color | Summarize the colors present in the segmented area of an image (Sumarizar as cores presentes na area segmentada de uma imagem).
thinning_image | This function makes the thinning images(Esta funcao faz o thinning em imagens).
tif_info | Image information in tif format (Informacoes das imagens no formato tif).
write_image | Function to save an image (Funcao para salvar uma imagem).